По сведениям газеты «КоммерсантЪ», следствие по делу о подрыве «Невского экспресса» cконцентрировалось на версии о причастности к теракту выходцев с Северного Кавказа. Предположительно, в деле замешана  группировка боевиков с Северного Кавказа. В настоящее время в Новгороде проходят массовые проверки граждан кавказской национальности, однако сведений о задержаниях пока нет.