Ей предъявлено обвинение в  "воспрепятствовании осуществления правосудия", "неуважении к суду" и "уничтожении документов". В настоящее время решением суда она находится под домашним арестом: она не имеет права покидать Бишкек и общаться с людьми, проходящими по ее делу. Сама Акаева говорит о том, что ее дело является политическим и не признает свою вину.